De werking van een inbouw en een vrijstaande magnetron zijn exact hetzelfde. Alleen heb je bij inbouw magnetron geen groot apparaat op het aanrecht staan. Als de magnetron gaat inbouwen is de nismaat van belang. Deze bepaald namelijk hoeveel ruimte je hebt om het apparaat in te bouwen. Deze bepaald dus hoe groot de magnetron kan zijn. Een combi magnetron is een combinatie van een magnetron en een oven. Afhankelijk van het model kan een combi magnetron voorzien zijn van een aantal functies. Bij hetelucht zorgt een ventilator in de achterwand ervoor dat de warme lucht gelijkmatig verdeeld wordt. Bij de functie conventioneel worden de gerechten bereid met boven- en onderwarmte. Met de grillfunctie krijg je een bruine en/of krokante korst. Ook is het grillen van vlees of vis minder vet. De meeste combimagnetrons beschikken over een stoomfunctie. Deze functie zorgt ervoor dat het vocht aan de kook wordt gebracht, waarna het op stoomtemperatuur wordt gehouden. Zo kunnen de etenswaren gestoomd worden.